Ghostwire: Tokyo — это приключенческая игра в жанре экшн и хоррор от первого лица. Игрок может использовать различные паранормальные способности, чтобы победить призраков и духов по всему Токио. Директор по боям Синитиро Хара описал сражения как «карате встречающее магию», поскольку персонаж игрока использует движения рук, вдохновлённые жестами рук кудзикири, для произнесения заклинаний. Когда враг теряет большую часть своего здоровья, его ядро обнажается, и игрок может использовать приёмы, чтобы уничтожить его, убивая духа.
Почти все жители Токио таинственным образом исчезли, и в город вторглись потусторонние духи (известные как Посетители). В это же время сверхъестественные силы главного героя начинают проявляться. Когда игрок сражается с духами, преследующими город, он встречает группу в масках Хання, которая может раскрыть тайну странных событий происходящих в столице Японии.